Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms