Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM175Q9BSA9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM175Q9BSA9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM175Q9BSA9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM175Q9BSA9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM175Q9BSA9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms