Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM83CQ9BQN1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM83CQ9BQN1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms