Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms