Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms