Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC22A12Q96S37 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC22A12Q96S37 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms