Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms