Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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