Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTHRC1Q96CG8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms