Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms