Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC1Q96C34 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms