Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms