Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPRTQ96BW1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms