Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms