Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms