Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NBEAQ8NFP9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms