Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM46DQ8NEK8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM46DQ8NEK8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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