Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R6

CDRT4, CMT1A duplicated region transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT4Q8N9R6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT4Q8N9R6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms