Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms