Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms