Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME9Q86XW9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms