Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms