Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUFY3Q7L099 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUFY3Q7L099 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms