Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms