Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms