Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP3Q6NUK4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms