Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TYW3Q6IPR3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms