Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIGD3Q6B0B8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms