Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms