Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms