Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms