Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms