Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms