Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms