Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms