Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms