Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms