Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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