Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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