Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms