Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms