Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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