Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
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