Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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