Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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