Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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