Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARF1Q14162 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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