Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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