Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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