Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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